Фамилия Ишкеев — один из вариантов более распространённой фамилии Ишкаев, и разобраться в её происхождении стоит через тюркское имя Ишкай. Оно построено просто: к корню «иш» (со значением «ровня», «товарищ», «друг») добавляли уменьшительно-ласкательный суффикс -кай-. В результате получалось слово «ишкай» — то есть «дружок». Имя звучало тепло, почти по-домашнему, и нарекая им сына, родители желали, чтобы мальчик вырос настоящим мужчиной и верным другом.

Переход от Ишкай к Ишкеев — дело фонетики: в русском языке при адаптации тюркских имён гласный «а» в суффиксе часто менялся на «е» (сравните с фамилиями Абдулкаев — Абдулкеев, Мамаев — Мамеев). Поэтому Ишкеев — не ошибка, а закономерный вариант, закрепившийся в документах.

Суффикс -ев указывает на типичную русскую модель образования фамилий от имён на -й: «чей?» — Ишкеев, то есть сын Ишкая. Фамилия тюркская по корню, но русская по форме — таких в Поволжье и Приуралье множество. Носители Ишкеевых, скорее всего, происходят из татарской или башкирской среды, где имя Ишкай было в ходу.

В ономастических справочниках (например, у Гафурова или Саттарова) имя Ишкай фиксируется как производное от «иш» с ласкательным аффиксом, без мистических или сложных толкований. Никакой связи с «ишаком» или другими случайными созвучиями нет — это чисто антропонимическая модель.

Если ваша фамилия Ишкеев, то предок носил тюркское имя, которое буквально означало «дружок» — доброе, человеческое прозвище, без намёка на сословие или профессию.