Фамилия Ишкеев представляет собой вариант фамилии Ишкаев и происходит от тюркского имени Ишкай, которое образовано путем присоединения к корню «иш» со значением «ровня, товарищ, друг» уменьшительно-ласкательного суффикса -кай-. Таким образом, слово «ишкай» имеет значение «дружок». Вероятно, нарекая ребенка таким именем, родители желали, чтобы их сын стал настоящим мужчиной и верным другом. Таким образом, потомок человека, которого звали Ишкай, со временем получил фамилию Ишкеев.