Фамилия Ишутин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Ишутин послужило церковное имя Иван. Поэтому от него было образовано множество уменьшительных форм, одна из которых — Ишута - и легла в основу фамилии. Однако, скорее всего, имя Иван исторически восходит к каноническому мужскому личному имени Иоанн, которое в переводе с древнееврейского означает «милость Божья». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ишута, со временем получил фамилию Ишутин. О точном месте и времени возникновения фамилии Ишутин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Ишутин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.