Фамилия Ишутовы (в мужском роде — Ишутов) образована от личного имени Ишута — одной из многочисленных уменьшительных форм крестильного имени Иван. Само имя Иван восходит к каноническому Иоанн, которое в переводе с древнееврейского означает «милость Божья». Фамилия относится к распространённому типу русских фамилий, сформированных по патронимической модели: основа (Ишут-) + суффикс принадлежности (-ов). Буквально она означает «сын Ишуты» или «потомок Ишуты».

Имя Ишута — не единственная производная форма от Ивана. В русских говорах бытовали десятки вариантов: Ишуня, Ишата, Ишак, Ишутка и другие. От них, в свою очередь, пошли фамилии Ишунин, Ишатов, Ишаев, Ишуткин. Фамилия Ишутов — одна из самых распространённых в этом гнезде. Суффикс -ут- в основе (Иш-ут-а) характерен для севернорусских и некоторых среднерусских говоров, где такие формы были особенно употребительны. Это даёт основание предполагать, что географические корни фамилии — в северных или центральных областях России, хотя документально подтвердить это сложно.

О точном времени возникновения фамилии Ишутов говорить трудно: процесс закрепления фамилий растянулся на несколько столетий, с XV по XVIII век. Однако модель «имя на -ута + -ов» — одна из наиболее архаичных, и первые носители такой фамилии могли появиться ещё в допетровскую эпоху. Важно понимать, что Ишутов — не дворянская и не купеческая фамилия по умолчанию. Чаще всего её носили крестьяне и посадские люди, а имя Ишута могло быть как крестильным, так и обиходным, уличным прозвищем.

Несмотря на кажущуюся простоту, фамилия Ишутов — ценный памятник русской антропонимии. Она сохранила живую народную форму имени, которая сегодня почти вышла из употребления, и демонстрирует, как через суффиксы и окончания язык передавал родственные связи и социальный контекст нескольких поколений.