Фамилия Истратий (встречается также вариант Истратие) — одна из тех, где за привычным звучанием скрывается сразу несколько возможных путей происхождения. В основе лежит крестильное имя, но вот какое именно — тут мнения расходятся.

Самая распространённая версия ведёт фамилию к греческому имени Евстратий (Евстрат), что означает «добрый воин». В русских говорах, особенно там, где было распространено «иканье» (произношение «и» на месте безударного «е»), форма Евстратий легко превратилась в Истратий. Так церковное имя, пройдя через живую народную речь, дало начало фамилии. Скорее всего, человек, первым получивший это прозвище или неполное имя, был из простого сословия — крестьянской или рабочей среды, где полные календарные формы часто заменяли более короткими и удобными в быту.

Есть и другая версия, менее очевидная, но лингвистически возможная. Истратий мог возникнуть как производная форма от имени Калистрат (от греческого «прекрасный воин»). В этом случае корень подвергся ещё более сильному сокращению: начальное «Кали-» отпало, а оставшаяся часть зазвучала как Истрат. Оба варианта — и от Евстратия, и от Калистрата — объединяет одно: фамилия образована от имени, а не от прозвища по профессии или внешности.

Сама фамилия по модели образования — типичная русская «фамилия-имя»: она не получила суффикса -ов или -ин, а застыла в форме исходного имени. Такое случалось, когда имя отца становилось родовым прозванием без дополнительных оформлений (как, например, фамилии Третьяк, Сорока или Ждан). Поэтому Истратий — это одновременно и имя предка, и фамилия его потомков.

Точное место и время возникновения фамилии сейчас установить трудно: процесс закрепления фамилий на Руси шёл несколько столетий, и в разных регионах он завершался в разное время. Однако ясно, что фамилия Истратий — не случайный набор звуков, а живой след того, как церковнославянские имена осваивались повседневным русским языком, приобретая местные черты и новые формы.