Фамилия Кабардукова — женская форма фамилии Кабардуков, и её разбор стоит начать с неочевидного на первый взгляд корня. Вопреки возможной ассоциации с кабардинцами или Кабардой, версия о происхождении от этнонима маловероятна: фамилии, напрямую образованные от названий народов, обычно выглядят иначе (Кабардинов, Кабардинцев). Здесь другая словообразовательная модель.

Основа «кабард» скорее всего восходит к тюркскому или адыгскому прозвищу. В тюркских языках «кабар» — весть, известие, новость. Суффикс «-ук» (в мужской форме Кабардуков) характерен для украинских, белорусских и южнорусских фамилий, часто указывая на прозвище: Кабардук — «вестник», «тот, кто приносит вести», или же человек, получивший такое прозвище за болтливость или осведомлённость. В адыгском языке есть слово «кабардэ» — «длинный» (о предмете), что могло стать прозвищем высокого или худощавого человека.

Суффикс «-ов» в окончании — стандартный русский патроним, указывающий на принадлежность: «сын Кабардука». Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, был прозван Кабардуком — либо за профессию гонца или глашатая, либо за внешность. Географически фамилия тяготеет к югу России, особенно к Ставрополью и Ростовской области, где исторически было сильное тюркское и кавказское влияние.

Написание с буквой «а» в первом слоге устойчиво, но в старых переписях могло встречаться и через «о» (Кобардуков) — это следствие акающего произношения. Встречаемость фамилии сегодня невысокая, что говорит о её локальном происхождении, возможно, от одного конкретного рода в казачьей или крестьянской среде.