Фамилия Кабатин происходит от прозвища Кабат. Чаще всего его связывают с названием верхней одежды — кабатом, длинной рубахой, которую надевали поверх кафтана. Скорее всего, прозвище дали либо портному, который шил такую одежду, либо торговцу, либо просто человеку, который её постоянно носил. Модель образования здесь прозрачна: основа Кабат- плюс типичный русский фамильный суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Кабата).

У этой фамилии есть и вторая, менее очевидная версия происхождения. В татарском языке слово «кабат» означает «опять, снова, вновь» или «несколько раз». Если исходить из этого корня, прозвище могли дать позднему или не первому ребёнку в семье — тому, кто «вновь появился» у матери. Такое объяснение встречается реже, но оно не лишено оснований, особенно если учесть, что на Руси существовала традиция давать «порядковые» прозвища по очерёдности рождения.

В письменных источниках прозвище встречается с XVI века. Известен Андрей Степанович Кабат Корсаков (1527 год) — двойное именование, где прозвище выступало в роли родового уточнения. Позже фигурирует Онисим Кабатов, дьяк Устюжской четверти (1678 год). Обратите внимание: в документах XVII века фамилия зафиксирована в форме Кабатов, а не Кабатин. Это не ошибка, а вариант оформления: суффиксы -ов и -ин в то время могли конкурировать, особенно если основа воспринималась то как нарицательное существительное мужского рода (тогда -ов), то как прозвище на твёрдый согласный (тогда -ин). Фамилия Кабатин — более поздняя и устойчивая форма, закрепившаяся в роду.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России. Устюжская четверть, где служил дьяк Кабатов, охватывала земли современной Вологодчины и Архангельской области. Это косвенно указывает, что прозвище могло быть связано именно с одеждой: на севере кабат как вид рабочей или дорожной верхней одежды был широко распространён.