Фамилия Кадырахунов — редкий пример трёхкомпонентной патронимической фамилии с восточным корнем, который редко встречается в русском ономастиконе. Она образована от арабского имени Кадырахун, которое, в свою очередь, является сложением двух элементов: «Кадыр» (араб. قادر — «могущественный», «всемогущий», один из эпитетов Аллаха) и «ахун» (перс. آخوند — «наставник», «учёный», «учитель»). В тюркской среде, особенно у узбеков, таджиков и уйгуров, «ахун» означало религиозного авторитета, знатока ислама, часто муллу. Таким образом, имя Кадырахун буквально переводится как «могущественный наставник» или «всемогущий учёный», что звучало как пожелание духовной силы и уважения.

Модель образования фамилии — русский патронимический суффикс -ов, добавленный к восточному имени. Это типичная для XIX–XX веков практика русификации: носители тюркских и иранских имён, попадая в состав Российской империи, получали фамилии по отцу через суффикс -ов/-ев. В данном случае суффикс присоединяется к полной форме имени (Кадырахун + ов), что встречается реже, чем усечение основы (например, Кадыров от Кадыр). Это указывает на позднюю фиксацию фамилии, возможно, при переписи или в документах, когда имя отца было записано целиком.

Географически фамилия тяготеет к регионам Средней Азии и Поволжья — Узбекистан, Таджикистан, а также татарские и башкирские области России. В русском контексте она почти не встречается за пределами этих диаспор. Споров о происхождении корня нет: арабская и персидская основы прозрачны. Слабая гипотеза, что «ахун» могло быть тюркским прозвищем (от «ағун» — «белый»), но она не выдерживает критики, так как в исламской антропонимике «ахун» устойчиво закрепилось именно как религиозный титул.

Среди однокоренных фамилий — Кадыров, Кадырбаев, Ахунов. Кадырахунов стоит особняком из-за двойного ударения: в разговорной речи его часто произносят с ударением на первый слог (Кады́рахун), хотя по правилам русского языка ударение падает на последний слог (Кадырахуно́в), как в фамилиях типа Ахундов. Эта двойственность — следствие столкновения восточной просодии с русской грамматикой.