Фамилия Какунова — женская форма, мужской вариант — Какунов. В её основе лежит прозвище или нецерковное имя Какун, которое на Руси давали по двум разным линиям, и обе ведут в одну смысловую область — громкую, неспокойную речь.

Первая версия, самая прямая: от глагола «какать» в древнерусском значении «издавать звук «ка», каркать». В южных и западных говорах «какун» — это крикливый, горластый человек, тот, кто много и без толку говорит, перебивает. Вторая, не менее вероятная: от тюркского корня «как» — «смотреть, глядеть», но в русской среде он переосмыслился в сторону звукоподражания. В рязанских и тамбовских говорах «какун» означало ещё и «петух» — тоже из-за крика.

Суффикс -ов- указывает на типичную модель образования русских фамилий: Какун → Какунов → Какунова. Первым носителем фамилии мог быть сын или дочь человека по прозвищу Какун. Фамилия редкая, недворянская, скорее крестьянская или мещанская, и географически привязана к центральным и южнорусским областям. Встречается преимущественно в Тульской, Рязанской и Воронежской губерниях — там, где «какун» как прозвище было в ходу.

Интересная деталь: в отличие от фамилий, образованных от церковных имён (Иванов, Петров), Какунова идёт напрямую от бытового прозвища, которое фиксировало конкретную черту человека. Сейчас это звучит необычно, но в XVI–XVII веках «Какун» было обычным мирским именем, и его давали не в обиду, а по внешнему или поведенческому признаку. Так что предки носительницы фамилии, скорее всего, были людьми заметными — звонкоголосыми, энергичными, может быть, скоморохами или глашатаями на сельских сходах.

Других версий, уводящих в сторону, например от греческого или финно-угорского, нет — корень прозрачный и устойчивый в русской диалектной лексике. Фамилия сохранилась в малочисленном, но живом виде, и её обладатели могут быть уверены: их родовая метка — не случайность, а прямое указание на характер предка.