Фамилия Калинишин — хороший пример того, как суффикс и ударение меняют привычную картину. На первый взгляд кажется, что перед нами типичная «калининская» фамилия: от имени Калина или фамилии Калинин. Но форма на -ишин указывает на другой механизм образования. В русской ономастике суффикс -ишин (как в фамилиях Строганишин, Кузьмишин) обычно присоединялся к основе, оканчивающейся на -а, и означал «чей?» — то есть сын или потомок человека. Если бы фамилия образована напрямую от имени Калина, мы бы получили Калинин или Калиничев. Здесь же основа — Калиниш-.

Самая вероятная версия: Калинишин — это вариант фамилии Калинышин или Калинищев, где суффикс -иш- имел увеличительное или пренебрежительное значение. В русских говорах «калинище» — не просто куст калины, а нечто большое или неуклюжее, либо прозвище рослого, костистого человека. Со временем «Калинище» превратилось в Калиниш, а от него через притяжательный суффикс -ин возникла фамилия Калинишин. То есть предок мог носить прозвище Калиниш (большой Калина, либо человек, связанный с калиной), а его дети стали Калинишиными.

Менее вероятна, но возможна версия от канонического имени Каллиник (греч. «добрый победитель»). В народной речи Каллиник превращался в Калину, Калинку, а форма Калиниш могла быть производной с тем же увеличительным оттенком. Однако прямых следов такого перехода в фамилии Калинишин нет — скорее это гипотеза для тех, кто хочет связать фамилию с церковным именем.

Географически фамилия редкая, встречается в основном на западе России и в Беларуси, где суффикс -ишин более характерен для польского и украинского влияния. В польской ономастике есть фамилия Kaliniszyn, что подтверждает западнорусский след.

Что касается сословия: фамилии на -ишин чаще встречались среди крестьян и мещан, реже — у духовенства. Дворянской ветви Калинишиных в истории не зафиксировано. Так что предки, скорее всего, были людьми простого звания, а прозвище отражало либо внешность, либо род занятий, связанный с калиной (сбор ягод, изготовление киселей, лечение).