Фамилия Калтыков — одна из тех, где корень почти наверняка тюркский, а суффикс — типично русский, указывающий на происхождение от отца или прозвища. Основа «калтык» в тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) означает «недостаток», «изъян», «остаток» или «неполноценный». В переносном смысле так могли прозвать человека с физическим недостатком, например, без одного глаза или с хромотой, либо того, кого считали неполноценным в каком-то ином смысле. Есть и другое значение — «остаток» (например, остаток ткани или пищи), но прозвище обычно давали по более яркой, заметной черте, поэтому версия с изъяном выглядит основной.

Модель образования проста: к основе «Калтык» прибавили фамильный суффикс -ов. Это значит, что первый носитель фамилии, скорее всего, был сыном или потомком человека по прозвищу Калтык. Такая модель широко распространена среди русских фамилий, особенно тех, что возникли в среде, где смешивались славянские и тюркские элементы — в Поволжье, Приуралье, Сибири. Калтыковы могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми, поскольку тюркские прозвища нередко получали и те, кто нёс военную или сторожевую службу на границах.

Интересно, что фамилия не слишком распространена, но встречается в нескольких регионах России, особенно в Татарстане и Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях. Это подтверждает её восточное происхождение. В старых документах, например, в писцовых книгах XVI–XVII веков, можно найти упоминания людей с прозвищем Калтык — как правило, это были «новокрещены» (принявшие православие) или выходцы из татарских родов, перешедшие на русскую службу.

Сравнение с однокоренными фамилиями, такими как Калтаков, Калтыгин, показывает, что корень «калт» в русском ономастиконе дал несколько вариантов, но Калтыков — самый прямой и прозрачный по смыслу. В отличие от фамилий на -ин, где основа могла быть женского рода, здесь всё однозначно: мужское прозвище и стандартный патронимический суффикс.