Фамилия Калтышов — один из тех случаев, когда за привычным русским окончанием скрывается неочевидная основа. Внешне она выглядит как типичная патронимическая фамилия на -ов, но её корень заставляет задуматься: ни имени, ни прозвища «Калтыш» в общерусском обиходе нет. Ответ, скорее всего, лежит в диалектной лексике или в искажённом тюркском слове.

Самый прямой путь — слово «калтыш». В южнорусских и донских говорах так называли короткий обрубок, огрызок, нечто усечённое. Прозвище Калтыш могли дать человеку невысокого роста, коренастому, либо тому, кто лишился части тела — руки или ноги. Такие прозвища были не редкостью в среде крестьян и казаков: они меткие, но без жестокости, скорее констатирующие внешнюю примету. Тогда фамилия Калтышов — это «сын Калтыша», а сам родоначальник жил в южных губерниях, где слово бытовало.

Есть и вторая версия, не менее правдоподобная. Основа «калт-» явно перекликается с тюркскими языками: «калта» или «калды» — остаток, оставшийся. В татарском и башкирском «калтыш» может означать «заика» или «шепелявый» (от «калтырау» — дрожать, запинаться). Если предок носителя фамилии был крещёным татарином или башкиром, его прозвище Калтыш (Заика) легко превратилось в русскую фамилию при переходе в православие. Эту гипотезу поддерживает распространённость фамилии в Поволжье и Приуралье, где русско-тюркские контакты были особенно плотными.

Написание фамилии устойчивое — через «ы», что характерно для русской адаптации тюркских основ. Формы «Колтышов» или «Калташов» встречаются, но реже, и они могут быть самостоятельными вариантами. Суффикс -ов указывает на то, что фамилия сформировалась не раньше XVII века, когда модель «прозвище + -ов» стала доминирующей для крестьян и посадских. Сословная принадлежность предков, скорее всего, была крестьянской или казачьей — дворянских родов с такой фамилией в истории не зафиксировано.

Таким образом, Калтышов — фамилия с двойным дном. Она могла родиться в русской деревне из меткого прозвища «коротышка» или прийти из тюркской среды как обозначение речевого дефекта. Обе версии имеют право на жизнь, и для конкретного носителя фамилии ответ часто даёт география предков: юг России склоняет к первой версии, Поволжье и Урал — ко второй.