Фамилия Калужин — одна из тех, где географическая привязка почти очевидна, но не единственная. Основная версия связывает её с городом Калуга, а точнее — с прозвищем человека, который оттуда родом или жил там. В старину выходцев из разных мест часто называли по названию города: калужанин, калуга, и со временем такое прозвище закреплялось за потомками. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «Калужин», то есть сын или потомок Калуги. Чередование г/ж в корне — результат обычного для русского языка фонетического перехода, когда твёрдый [г] перед гласным переднего ряда смягчался до [ж] (сравните: «нога» — «ножной»).

Само слово «калуга» в диалектах означало «топкое, болотистое место». Это тоже могло стать основой прозвища: человека, жившего у болота или на сырой почве, могли прозвать Калугой. Однако популярность и известность города Калуги делает первую версию более весомой. Город впервые упомянут в 1371 году в грамоте литовского князя Ольгерда, а в 1389 году вошёл в состав Московского княжества. Калуга долго служила крепостью на Оке, прикрывая Москву с юга и запада, и её жители участвовали в ключевых событиях — от Куликовской битвы до стояния на Угре в 1480 году. Поэтому прозвище «Калуга» могло указывать не просто на место жительства, а на человека, связанного с этой стратегически важной землёй.

Менее вероятная, но тоже встречающаяся гипотеза — от слова «калуга» в значении «крупная рыба, вид белуги». В таком случае прозвище получил бы рыбак или торговец рыбой. Но эта версия уступает первой и по частоте, и по логике: рыба «калуга» — узкорегиональное название, а город Калуга — широко известный топоним, который легче лёг в основу фамилии.

Таким образом, Калужин — это фамилия, которая скорее всего рассказывает о географическом происхождении предка: он был из Калуги или её окрестностей. Альтернативное значение — «живущий на болоте» — возможно, но менее вероятно.