Фамилия Канышкин — одна из тех, где на первый взгляд всё ясно, но при ближайшем рассмотрении открывается неожиданный простор для догадок. Она образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который в фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Канышкин, то есть сын или потомок Канышки. В основе лежит прозвище или имя Канышка. Но что оно означало?

Самая прямая версия отсылает к слову «каныш». В русских говорах, особенно на юге и в Поволжье, канышом называли дикую утку, нырка. Прозвище Канышка могли дать человеку за какую-то птичью черту — за манеру нырять, за худобу или за то, что он хорошо плавал. Такие «птичьи» фамилии (Соколов, Уткин, Гусев) очень распространены, и Канышкин стоит в этом же ряду, но с более редким корнем.

Вторая версия — тюркская, что для фамилий с таким звучанием тоже вероятно. В тюркских языках «кан» (хан) — правитель, а «ыш» — суффикс, дающий уменьшительное или ласкательное значение. Каныш или Канышка могло быть тюркским личным именем, означавшим «маленький хан» или «князёк». Такие имена нередко давали в русско-татарских семьях, и потом они превращались в фамилии. В этом случае Канышкин — потомок человека по имени Каныш.

Третья, менее вероятная, но возможная версия — от глагола «каныкать» (канючить, надоедливо просить). Прозвище Канышка могли дать назойливому человеку. Однако эта версия слабее: глагол редок, а фамилии от него почти не встречаются.

Фамилия Канышкин не относится к числу широко распространённых. Её можно встретить в Поволжье, на Урале и в Сибири — в тех регионах, где активно смешивались русские и тюркские традиции. Сословно носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами: фамилии на -ин с прозвищной основой типичны для непривилегированных слоёв. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Таким образом, Канышкин — фамилия с двумя равновероятными корнями: либо «утиная» (от каныша-нырка), либо «ханская» (от тюркского имени). И та, и другая версия имеют право на жизнь, и выбрать одну без знания конкретной семейной истории невозможно.