Фамилия Капаркалея — одна из тех, что сбивает с толку при первом взгляде: окончание не типично ни для русских, ни для украинских, ни для польских фамилий. На самом деле перед нами грузинская фамилия, записанная кириллицей. Исходная грузинская форма — Капаркалиа (ქაფარქალია). В Грузии такие фамилии на -иа распространены в основном в Мегрелии и Гурии (западная часть страны).

Основа фамилии — «капаркали». Это слово разложимо на две части: «капа» и «ркали». «Ркали» с грузинского переводится как «рог» или «рожок». «Капа» — более сложный элемент: это может быть либо искажённое «кваба» (камень, скала), либо «квепа» (резать, рубить). В любом случае, прозвище Капаркали (буквально «каменный рог» или «резаный рог») скорее всего относилось к человеку, который жил у скалистого обрыва, напоминающего рог, либо занимался выделкой роговых изделий — гребней, пороховниц, рукоятей. В горной местности Грузии рогатый скот был основой хозяйства, и рог как материал ценился высоко.

Суффикс -иа/-ия в грузинских фамилиях обычно указывает на принадлежность к роду или местности. То есть Капаркалея — это буквально «из рода того, кого прозвали Капаркали». В русской записи фамилия могла потерять мягкость окончания: вместо -иа закрепилось -ея, что встречается при адаптации мегрельских и гурийских фамилий (сравните: Чхеидзе → Чхеия, но тут иная модель).

География фамилии узкая. По данным открытых источников и справочников по грузинской ономастике, носители фамилии Капаркалиа (Капаркалея) исторически концентрируются в селах Чхороцкуского и Цаленджихского районов Мегрелии. В России фамилия встречается редко, в основном у потомков грузинских переселенцев XIX — начала XX века. Вариант написания через «е» (Капаркалея) мог закрепиться в паспортах из-за ошибок писарей или особенностей произношения в русской среде.

Итог: фамилия указывает на западно-грузинское происхождение, скорее всего мегрельское, и связана с прозвищем по месту жительства или ремеслу.