Фамилия Капацин — редкий пример, где основа явно польская, а суффикс — русский. Исходное прозвище Капац происходит от польского kapać — «капать». По смыслу это точный аналог русского прозвища Капля: такое имя давали либо маленькому ребёнку, либо невысокому человеку. В ономастике такие прозвища по принципу «маленький, как капля» встречаются у многих славянских народов и не требуют дополнительного мифологического объяснения.

В русских документах засвидетельствована фамилия Каплин (от той же основы). С. Б. Веселовский в своих работах приводит: Каплин Афанасий, посадский человек, 1660 г., Тотьма; Каплины, крестьяне, XVII в., Тотемский уезд. А также прозвище Капля: князь Василий Иванович Карголомский, конец XV в. Фамилия Капацин строится по той же модели, но с польским корнем и другим суффиксом.

Суффикс -ин в фамилии Капацин указывает на принадлежность: «чей?» — Капацин, то есть сын или потомок Капаца. В польской среде такое прозвище могло закрепиться за человеком, который перебрался на восточные земли Речи Посполитой или в русские области. Фамилия встречается в основном на западе современной России и в Беларуси — в зоне исторического польско-русского пограничья.

Других версий происхождения, например от тюркских или балтийских корней, нет — слово kapac не даёт правдоподобных альтернатив. Так что перед нами редкий случай, когда прозвище «капельного» человека пришло в русскую фамилию через польский язык.