Фамилия Капитанчик — редкий пример, где за основу взято воинское звание, но не напрямую, а через уменьшительно-ласкательный или ироничный суффикс. В отличие от распространённых Капитановых, образованных по стандартной модели «звание + -ов», здесь сработал другой механизм: прозвище Капитанчик давали человеку, который либо был маленького роста или щуплого телосложения, но носил фамилию Капитан или имел командирские замашки, либо, напротив, был низшим чином, которого в насмешку величали «капитаном». Суффикс -чик в русских фамилиях почти всегда указывает на прозвище, а не на службу: он придаёт оттенок уменьшительности или пренебрежения.

Разбираем словообразовательную цепочку. Основа — «капитан» (от позднелат. capitaneus — «главный, начальник»). В русском языке это звание закрепилось при Петре I, но в быту «капитаном» могли назвать любого старшего в артели, на судне или в крестьянской общине. Затем к основе добавили суффикс -чик, который в фамилиях часто передаёт не столько маленький размер, сколько принадлежность к низшей или зависимой группе. Сравните: Барабанщик, Извозчик, Пономарчик — все они указывают на ремесло или должность в уменьшительной форме. То есть Капитанчик — это не «маленький капитан», а скорее «тот, кто числится при капитане» или «капитан на вторых ролях».

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским землям, где суффикс -чик особенно продуктивен. В метрических книгах XIX века Капитанчики встречаются в Волынской, Киевской и Подольской губерниях, а также среди казачества. Это не случайно: в казачьей среде звания имели подвижный характер, и прозвище могло закрепиться за выборным атаманом небольшой ватаги или за писарем, которого в шутку называли «капитаном».

Спорный момент: не следует путать фамилию с еврейскими фамилиями на -чик, где суффикс часто указывает на профессию (например, Капланчик — от «каплан» (священник)). В случае с Капитанчик основа однозначно воинская, а не религиозная. Если предок был евреем, фамилия могла быть искусственной, данной при призыве в армию, но это маловероятно: в рекрутских списках обычно давали Капланчик или Капитанский.

В итоге: носитель фамилии Капитанчик с большой вероятностью происходит от человека, который либо командовал небольшим подразделением (десятком, обозом), либо получил прозвище за характер — бойкий, важный, но невысокий. Фамилия не дворянская, а народная, и её история — в бытовой иронии и социальной лестнице, где звание могло быть и почётным, и шуточным.