Фамилия Капитанников образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Капитанников образована от прозвища Капитанник. Скорее всего, оно ведет свое начало от слова «капитан» — «старший обер-офицер, военный чин 9 класса, сравненный с титулярным советником», «ротный командир», «командир морского судна». Вполне вероятно, что основатель рода Капитанниковых носил чин капитана, за что и получил соответствующее прозвище. Однако прозвище Капитанник мог носить и гражданский человек, который отличался такими чертами характера, как требовательность, строгость, решительность. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Капитанник, со временем получил фамилию Капитанников. О точном месте и времени возникновения фамилии Капитанников в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Капитанников представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.