Фамилию Капито не стоит путать с более распространённой Капитоновой: здесь нет суффикса -ов-, который обычно указывает на отчество. Капито — это «голая» основа, застывшая прозвищная форма. В русской антропонимике такие фамилии характерны для украинского, белорусского и южнорусского влияния, где фамилии часто образовывали без патронимического суффикса, просто от имени или прозвища.

Самая прямая версия — происхождение от крестильного имени Капитон. Имя это греческого корня (καπίτων) и означает «упрямый», «головастый» — от слова «капитон» (голова). В святцах есть святой Капитон, мученик III века. Если фамилия возникла в крестьянской среде, её могли дать по отцу: «чей? — Капитонов сын», но в украинской традиции часто отбрасывали суффикс, и сын записывался просто как Капито. Однако в русских переписных книгах XVII–XVIII веков встречаются и прямые прозвища Капито, например, среди старообрядцев — из-за известного расколоучителя Капитона Даниловского.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая: фамилия могла возникнуть от прозвища, связанного с диалектным словом «капито» — так в некоторых говорах называли капюшон, башлык или головной убор. Тогда прозвище получил человек, носивший такую шапку или шивший их.

Географически фамилия Капито встречается нечасто, но заметна в южных областях России (Курская, Белгородская области) и на востоке Украины. Встречается и у потомков казаков — там фамилии без суффиксов были нормой. Если ваш предок носил фамилию Капито, скорее всего, его звали Капитоном в миру, и фамилия закрепилась в форме прямого имени, без лишних приставок.