Фамилия Капошина — женская форма, а её мужской вариант — Капошин. Это относительно редкая фамилия, в основе которой почти наверняка лежит прозвище, а не крестильное имя.

Корень здесь — «капош-». В русских говорах слово «капоша» имело два основных значения. Первое — медлительный, копушливый человек, тот, кто долго возится, «капошится». Второе, более редкое — неопрятный, неряшливый человек. Оба значения уничижительные, но в бытовой среде такие прозвища давали без злого умысла, скорее как констатацию особенности характера или поведения. Поскольку слово «капошиться» (медлить, копаться) широко бытовало в северных и центральных областях России, можно предполагать, что фамилия зародилась именно там.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Капоша — Капошин сын, то есть сын человека по прозвищу Капоша. Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным словом «капот» (верхняя женская одежда) или с глаголом «капать», но для этого потребовались бы формы вроде «Капотин» или «Капкин», тогда как «Капоша» — самостоятельное, устойчивое прозвище.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто встречаются у бывших крестьян центральной России, Капошины могли быть выходцами из среды, где прозвища давали по поведенческим чертам, а не по профессии или отцу. Сословная принадлежность предков не устанавливается по одной фамилии: среди Капошиных могли быть и крестьяне, и мещане, и духовенство (хотя для последних типичнее фамилии на -ский). Встречаемость фамилии низкая, что говорит о её локальном происхождении — возможно, от одного-двух родов в конкретной губернии.