Фамилия Каприна образована от прозвища или нецерковного имени Капра. Основа здесь — не «каприз» и не «капризный», как может показаться на первый взгляд, а слово «капра» — так в южных и западных говорах называли козу. Соответственно, прозвище Капра мог получить человек с какими-то «козлиными» чертами: упрямством, бойкостью, возможно, длинной бородкой или особой манерой поведения. В некоторых диалектах «капра» означало также «козёл», так что прозвище могло быть и мужским.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Каприн — это «сын Капры» или «человек из семьи Капры». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от основ на -а/-я. Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская, распространённая в тех регионах, где бытовало слово «капра» — на юге России, в Белоруссии и на Украине. Встречаются и однокоренные фамилии Капров, Капранов, Капран, но Каприна стоит особняком именно из-за суффикса -ин.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с итальянским словом capra (коза) через возможное прозвище «Каприн» у человека, побывавшего в Италии или имевшего дело с итальянцами. Однако для русского ономастикона это скорее исключение, чем правило. Основной и надёжный корень — диалектный, животноводческий.

Написание фамилии не менялось, ударение обычно падает на второй слог: Капри́на. В женском роде фамилия склоняется как прилагательное: Каприной, Каприну. Встречаемость фамилии невысокая, что делает её редкой и локально привязанной к определённым говорам.