Фамилия Каптуровы образована от прозвища Каптур, которое восходит к польскому слову kaptur — «капор», то есть женский или детский головной убор с лентами, завязывающимися под подбородком. Такая основа указывает на род занятий предка: вероятнее всего, он был шапочником, скорняком или торговцем головными уборами. В старину мастера по шитью шапок и капоров называли каптурниками, и их нередко величали по изделию — Каптур.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к прозвищу на твердый согласный добавили суффикс -ов, означающий принадлежность («чей?» — Каптуров сын). Такая модель стала массовой в XV–XVII веках, когда крестьяне и посадские люди получали фамилии по отцовскому прозвищу. В данном случае суффикс -ов указывает, что прозвище было мужским и закрепилось за главой семьи.

Слово kaptur — заимствование из польского, что нередко для западных и южных регионов России, где было распространено польско-литовское влияние. Это позволяет предположить, что корни фамилии Каптуровых могут лежать в Смоленщине, Брянщине или на землях бывшего Речи Посполитой, где польская лексика проникала в местные говоры. В русских диалектах слово «каптур» также известно — им называли не только капор, но и капюшон, а иногда и монашеский клобук.

О точном времени возникновения фамилии говорить сложно — процесс формирования фамилий у крестьян растянулся до XIX века. Однако сам прозвищный тип (Каптур) мог возникнуть гораздо раньше, в XVI–XVII веках, когда ремесленные прозвища были особенно распространены. Фамилия Каптуровы — не единичный случай; в той же словообразовательной гнезде стоят фамилии Каптур, Каптуровский, Каптуренко, что подтверждает живую народную традицию называть человека по его ремеслу или предмету обихода.