Фамилия Капутерко звучит необычно для русского уха, и это подсказка: её корни, скорее всего, не в великорусской, а в украинской или белорусской среде. Суффикс -ко — один из самых характерных признаков украинских фамилий, особенно распространённых на Левобережье и в Полтавской области. Этот уменьшительно-ласкательный суффикс часто присоединяли к прозвищам или названиям профессий, превращая их в родовое имя.

Основа «капут-» сразу вызывает ассоциацию с латинским caput — «голова» или с немецким Kaputt — «разбитый, испорченный». Вторая версия проще и правдоподобнее: в украинских говорах словом «капут» могли называть человека, который часто попадал в неприятности, ломал вещи или был неудачником. Прозвище Капут давали тому, о ком говорили: «Ну, всё, капут!» — то есть конченый, пропащий человек. Со временем оно смягчилось суффиксом -ерко, который мог возникнуть под влиянием польских или немецких фамилий на -ер.

Есть и более узкая, профессиональная версия. В польском языке kaputrnik — это портной, шьющий капоты (вид верхней одежды, балахон). Если предок действительно шил капоты, его могли прозвать Капутером, а потом переделать на украинский лад в Капутерко. Но эта версия менее распространена, так как следов такого ремесленного термина в украинских диалектах почти не осталось.

По географии фамилия Капутерко встречается в основном в западных и центральных областях Украины, а также среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке. В России она редкая и часто воспринимается как экзотическая. Сословно носители фамилии были, как правило, крестьянами или казаками — суффикс -ко в XVI–XVIII веках активно использовался именно в этих средах, а не у шляхты.

Таким образом, Капутерко — это, скорее всего, прозвищная фамилия, возникшая в украинской среде от слова «капут» в значении «неудачник» или «сломанный». Суффикс -ко закрепил её в ряду типичных украинских фамилий, а само прозвище могло быть ироничным, данным в насмешку за безалаберный или невезучий характер предка.