Фамилия Капузо — редкий случай, где написание почти полностью совпадает с произношением, а корень отсылает к вполне конкретному предмету. В основе лежит слово «капуста», но не напрямую, а через уменьшительно-ласкательную или диалектную форму. В южнорусских и украинских говорах «капуз» или «капузка» — это кочан капусты, иногда так называли и самого человека: плотного, круглого, невысокого. Прозвище Капуз давали либо огороднику, торговавшему капустой, либо тому, кто внешне напоминал кочан — коренастому, с широким лицом.

Фамилия образована по типичной восточнославянской модели с суффиксом -о: в украинской и белорусской традиции фамилии на -о (Капузо, Ковалёв, Бондаренко) часто фиксировались в документах без дальнейшего склонения. Мужская фамилия Капузо могла возникнуть в среде казачества или крестьянства, где прозвища закреплялись за родом без добавления патронимического суффикса -ов/-ев. В русском языке аналогом была бы фамилия Капузов, но форма на -о указывает на юго-западное происхождение — скорее всего, из Черниговской, Полтавской или Харьковской губерний.

Встречается и альтернативная версия: от тюркского «капуз» (арбуз) через диалектный обмен. Но для фамилии Капузо она маловероятна, потому что в тех же говорах «кавун» (арбуз) и «капуз» (капуста) не смешивались. Правдоподобнее, что прозвище дали по капусте — овощу, который в центральной и южной России был основой крестьянского стола, и человека могли назвать по его занятию или привычке.

Фамилия недворянская и нестарая, документально фиксируется с XIX века, в основном в метрических книгах сёл Харьковской и Екатеринославской губерний. Встречается редко, что говорит о небольшом роде, не разросшемся по стране. Сегодня носители Капузо живут в основном в Украине и на юге России, единичные случаи — в дальнем зарубежье среди потомков эмигрантов первой волны.