Фамилия Караджан в русском контексте — почти всегда пришелец. Её не объяснить славянскими корнями или суффиксами вроде -ов или -ин. Основа здесь — тюркская, а точнее, тюрко-персидская смесь. Кара (kara) по-тюркски означает «чёрный», а джан (can, jan) — «душа» или «жизнь» (из персидского, широко разошедшееся по всему тюркскому миру). Вместе «караджан» можно перевести как «чёрная душа» или «тёмная душа». Звучит мрачно, но в ономастике такие прозвища часто давали не за злодейство, а за внешность (смуглый, черноволосый) или как оберег — от сглаза.

Вторая, менее очевидная версия — топонимическая. Караджан — это и название села в Армении (сейчас территория Турции), и ряд мелких географических точек в Крыму и Азербайджане. Предок мог получить фамилию по месту, откуда вышел: «Караджанский» или просто «Караджан» как указание на родину. В таком случае это не прозвище, а готовый этнотопоним, который закрепился без изменений.

Фамилия не склоняется по падежам в мужском и женском вариантах — это типично для фамилий на согласный, особенно восточного происхождения. Встречается она в основном у крымских татар, армян (в том числе армяно-тюркское население), а также у греков Приазовья, где тюркские заимствования не редкость. В русских документах XIX века носители Караджан фиксировались как мещане и крестьяне южных губерний — Таврической, Екатеринославской.

Интересная деталь: в некоторых диалектах ударение падает на последний слог (Караджáн), в других — на первый (Кáраджан). Это не ошибка, а следствие разного языкового фона: носители из армянской среды чаще тянут ударение на конец, из тюркской — на начало.