Фамилия Карапутин — редкий случай, когда в основе лежит не профессия и не черта характера, а слово, которое сегодня имеет совсем другое значение. Современный «карапуз» ассоциируется с малышом, пухлым ребёнком. Однако в русских говорах XIX века «карапузом» или «коропузом» называли не только младенца, но и низкорослого, коренастого мужчину, а также — с иронией — короткий и толстый предмет. Прозвище Карапуз давали человеку невысокого роста, плотного телосложения, возможно, с крупным животом. Именно от этого прозвища и пошла фамилия Карапутин, причём по довольно редкой модели.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Карапутин, то есть сын Карапуза. Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а/-я. Куда чаще встречается вариант Карапузов (от той же основы, но с суффиксом -ов, как, например, Иванов). Вариант на -ин встречается реже, что и делает фамилию более локальной и, вероятно, северной или центральнорусской по происхождению — в этих регионах суффикс -ин был особенно активен.

Если копнуть глубже, слово «карапуз» само по себе составное: тюркское «кара» (чёрный) и русское «пузо» (живот). В диалектах встречалось и «чернопузый» — так могли называть человека либо за смуглую кожу, либо за то, что он носил тёмную, выпачканную одежду, либо просто за большой живот. Но основная версия остаётся прозвищной: предок носителя фамилии Карапутин был человеком приземистым, плотным, возможно, с заметным брюшком. Никаких сведений о дворянском происхождении или принадлежности к известному роду у этой фамилии нет — она из разряда «простых», крестьянских или мещанских, что нисколько не умаляет её колорита.