Фамилия Кардупа — редкая и нестандартная для русского слуха. В ней нет привычных фамильных суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает на её нерусское происхождение. Скорее всего, перед нами украинская или белорусская фамилия, образованная от прозвища без дополнительного оформления — так называемая «чистая» основа, которая и стала наследственной.

Корень «кардуп» в славянских говорах имеет несколько значений. В украинском языке «кардуп» или «кардуб» — это пень, колода, обрубок дерева. Прозвище Кардупа могли дать человеку коренастому, плотному, невысокому, похожему на крепкий пенёк. В польском языке есть слово «kardup» с похожим значением — «коротышка», «толстяк». Таким образом, фамилия описывает внешность или телосложение первого носителя.

Вторая версия менее распространена, но имеет право на существование. В некоторых западных диалектах «кардупа» могли называть человека, который занимался обработкой коры или луба — сырья для мочала и верёвок. Это ремесло было распространено в лесных районах Полесья. Если принять эту версию, фамилия относится к «профессиональным» прозвищам, как, например, Лубенник или Мочальников.

Географически фамилия Кардупа встречается в основном на западе Украины — в Волынской, Ровенской, Львовской областях, а также в юго-восточной Польше. В России она почти не встречается, что подтверждает её локальный западнославянский или украинский ареал. Интересно, что в польских источниках встречается похожая фамилия Kardupa — с тем же корнем, но с другим ударением.

Особенность фамилии в том, что она не получила «русификации»: не стала Кардуповым или Кардупиным. Это говорит о том, что её носители долгое время жили в среде, где фамилии передавались без изменений, или же фамилия закрепилась уже в поздний период, когда массовая унификация фамилий через суффиксы уже не была обязательной.