Фамилия Кардынов — яркий пример того, как географическое название или тюркское прозвище превратилось в русскую фамилию с помощью простого суффикса -ов. Основа «Кардын» не имеет славянских корней, и это сразу указывает на регион происхождения: скорее всего, Северный Кавказ или Поволжье, где веками жили тюркские и кавказские народы.

Самая вероятная версия связывает фамилию с кабардино-черкесским словом «къардэн» — так называли бурку, войлочный плащ без рукавов, который носили горцы. Прозвище Кардын могли дать человеку, который шил или торговал бурками, либо тому, кто постоянно ходил в такой одежде. В карачаево-балкарском языке есть близкое слово «кърдын» — «спина», но эта версия менее убедительна, так как прозвища по частям тела редко ложатся в основу фамилий без дополнительного смысла (например, «горбатый» или «широкоплечий»).

Не исключено, что в основе лежит топоним — название реки, горы или аула. На карте Кабардино-Балкарии можно найти реку Кардын (приток Терека) и одноимённое урочище. В таком случае фамилия образована по модели «житель местности + -ов»: Кардынов — «тот, кто с Кардына». Эта версия особенно правдоподобна для фамилий, распространённых среди кабардинцев и балкарцев, которые часто брали фамилии по названию родового селения.

Словообразовательная модель проста: к основе «Кардын» добавили русский патронимический суффикс -ов, который в XIX–XX веках стал универсальным способом русификации фамилий нерусских народов. Поэтому среди носителей фамилии Кардынов много представителей кавказских народов, особенно кабардинцев, черкесов и балкарцев. В русских метрических книгах фамилия встречается редко, в основном на Северном Кавказе и в казачьих станицах.

Склоняется фамилия по стандартному правилу: мужской вариант — Кардынов, Кардынова, Кардынову; женский — Кардынова (не склоняется, если речь о женщине). Ударение, судя по тюркскому произношению, падает на первый слог: Ка́рдынов.