Фамилия Кардыяков — редкая, и её разговорная, «избяная» природа видна сразу. Она образована не от церковного или книжного имени, а от прозвища, которое, скорее всего, описывало внешность или характер человека. В основе лежит слово «кардыга» или «кардяга», которое в южнорусских и украинских говорах означало «короткий, обрубок», а также «заскорузлый, невысокий человек». То есть Кардыяком в XVI–XVII веках могли прозвать коренастого, плотного мужчину, возможно, с грубоватыми чертами.

Словообразовательная модель проста и типична для русского крестьянского и служилого сословия: прозвище Кардыяк + патронимический суффикс -ов, который указывал на принадлежность к роду («чей?» — сын Кардыяка). Интересна фонетическая особенность: в прозвище ударение, вероятно, падало на второй слог (Карды́як), и при добавлении суффикса оно сместилось на окончание, дав современное звучание Кардыяко́в.

Географически фамилия привязана к югу России — Курской, Воронежской, Ростовской областям, а также к восточной Украине. В дореволюционных переписях она встречается в среде однодворцев и государственных крестьян. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её непритязательное, бытовое происхождение.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает основу с тюркским «карды» (брат) и суффиксом -як, что могло дать прозвище «братец, товарищ». Однако эта гипотеза не подкреплена ни ареалом фамилии, ни письменными источниками — южнорусские говоры дают более прямую и убедительную этимологию.

По сравнению с однокоренными фамилиями (Кардымов, Кардышев), Кардыяков стоит особняком: суффикс -яков (от -як) встречается реже, чем -ов или -ев, и подчёркивает прозвищную, а не именную природу основы. В современной России фамилия остаётся малочисленной, но сохраняет связь с конкретным регионом и социальным слоем — крестьянством южных окраин.