Фамилия Каркус образована от прозвища Карк. Оно, в свою очередь, вероятно, восходит к литовскому глаголу karkti, который переводится на русский язык как «клохтать; кряхтеть; хрипеть». Таким образом, можно предположить, что основателю рода дали прозвище из-за того, что он всегда кряхтел, покашливал. Также он мог просто быть ворчуном. Согласно другой версии, прозвище Карк произошло от эстонского слова kark, которое в переводе на русский язык означает «костыль». В таком случае, такое прозвище получил хромой человек, передвигавшийся при помощи костыля. Но основателя рода могли прозвать и из-за того, что он был продавцом костылей или занимался их изготовлением.