Фамилия Карпушка звучит на слух как уменьшительно-ласкательная форма, и это прямое указание на её происхождение. В основе лежит каноническое имя Карп, которое пришло на Русь вместе с христианством из греческого языка и переводится как «плод». Имя было распространено среди простых людей, а его уменьшительные формы — Карпуша, Карпушка — в быту встречались повсеместно. Фамилия Карпушка образовалась не через стандартный суффикс принадлежности (-ов, -ин), а путём застывания самого прозвища или уличного имени в именительном падеже. Это так называемые «нетитлованные» фамилии, характерные в основном для украинской, белорусской и южнорусской традиции, где человека могли записать просто по его обиходному имени: Карпушка, а не Карпов или Карпушин.

Такая модель образования говорит о том, что предок носителя фамилии, скорее всего, был человеком незнатного происхождения — крестьянином, ремесленником или казаком. В официальных документах, особенно в переписных книгах XVII–XVIII веков, западных и южных регионов России, а также на землях бывшей Речи Посполитой, фамилии без суффиксов встречались часто. Запись «Иван Карпушка» означала, что человека зовут Иван, а его отца или его самого в деревне кличут Карпушкой. Со временем это прозвище закрепилось за потомками как наследственная фамилия.

Географически фамилия тяготеет к западу и югу: её корни уверенно прослеживаются в Беларуси, на Украине, а также в Брянской, Смоленской и Курской областях России. В этих краях имя Карп и его производные были особенно популярны, что подтверждается местными говорами, где «карпушка» могло быть и просторечным названием самой рыбы карп. Впрочем, версия с рыбой менее вероятна: в ономастике принято считать, что фамилии, образованные от личных имён, встречаются в разы чаще, чем от названий животных или рыб. Спорных гипотез здесь нет — все исследователи сходятся на имени Карп как на первичной основе.

Интересная деталь: фамилия Карпушка — редкий пример того, как суффикс субъективной оценки (-ушк-, -юшк-) стал частью официального родового имени. В русской традиции такие суффиксы обычно оставались в пределах уменьшительных форм и редко переходили в фамилии, а вот в украинской и белорусской они прижились легче. Поэтому носитель фамилии Карпушка, скорее всего, имеет предков из тех мест, где язык и обычаи были более свободны в обращении с именами, а сама фамилия хранит отпечаток тёплого, домашнего обращения к основателю рода.