Фамилия Кассина образована от имени Касся — краткой формы христианских имён Кассиан и Кассиодор. В основе лежит латинское слово «Cassius», то есть «Кассиев сын, потомок». Имя Кассиан было на Руси довольно популярно, его носили несколько почитаемых святых: преподобный Кассиан Римлянин, святитель Кассиан, епископ Нарнский, преподобный Кассиан Комельский, а также Кассиан грек, Угличский, и Кассиан Авнежский.

Фамилия образована по стандартной модели: к основе «Кассин-» добавили окончание «-а». В русской ономастике фамилии с таким окончанием чаще всего встречаются на юге и западе страны, в частности на Украине и в Беларуси, где сохранилась традиция склонять фамилии по женскому роду. В центральной и северной России фамилия, скорее всего, закрепилась бы как Кассин.

Скорее всего, основатель рода Кассиных был человеком из простого сословия — крестьянином или ремесленником. В крестьянской среде полные церковные имена часто сокращали до бытовых форм: Касся, Кася. Потомок человека по имени Касся со временем и получил фамилию Кассина.

Фамилия редкая, в отличие от распространённой Кассин, и её написание с двумя «с» и окончанием «-а» может указывать на конкретный регион бытования или на то, что запись фамилии закрепилась в документах через женскую линию.