Фамилия Кажаев образована от мужского тюркского имени Кожай, которое, в свою очередь, восходит к персидской именной основе «хожа» («ходже») - «начальник, глава семьи, хозяин, владелец, господин, учитель, мудрец». Компонент «ай» в древнетюркском языке имел следующие значения: «месяц»; «красивый, ценный; святой; чистый, светлый, лучистый; умный; дорогой; обильный; счастливый; полный» и др. Согласно другой гипотезе, фамилия Кажаев ведет свое начало от прозвища Кажай, которое представляет собой тюркский вариант русского слова «кожевник» (мастер, занимающийся выделкой шкур). Вероятно, это прозвище относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности предка.