Фамилия Келле — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычную модель русских фамилий на -ов, -ин или -ский. Её происхождение почти наверняка нерусское, и чтобы понять, откуда она взялась, нужно смотреть в сторону немецкого или финского языков.

Самая вероятная версия — немецкая. В немецком языке слово «Kelle» означает «мастерок» (инструмент каменщика) или «половник, ковш». Фамилия Келле могла возникнуть как профессиональное прозвище: либо строителя, либо человека, работавшего на кухне или в питейном заведении. Немецкие фамилии на -е (Kelle, Maus, Fuchs) нередко оставались без изменений при переходе в русскую среду, особенно если носитель был выходцем из немецких колоний в Поволжье или Прибалтике. В XVIII–XIX веках в России осело много немецких ремесленников и специалистов, и их фамилии закреплялись в документах в исходном виде.

Вторая версия — финская. В финском языке «kellä» — это форма слова «часы» (времени) или «колокол» (kello). Фамилия Келле могла быть финским прозвищем для звонаря, часовщика или человека, жившего у колокольни. Это объясняет её бытование на северо-западе России, в Карелии и Ленинградской области, где финно-угорский субстрат силён. Фамилия Келле встречается в метрических книгах Санкт-Петербургской губернии и в списках ингерманландских финнов.

Третья, менее распространённая гипотеза — искусственное происхождение. В советское время при смене фамилий или при записи детей в смешанных браках могли дать короткую, лёгкую для произношения форму. Но для этой версии нет надёжных подтверждений.

Словообразовательно фамилия Келле — это чистая основа без суффикса. В русском языке такие фамилии (Келле, Шилле, Гёте) — признак иноязычного заимствования. Ударение, скорее всего, падает на первый слог: Ке́лле.

Географически фамилия не массовая. Её носители в России — это потомки немецких колонистов (особенно из Саратовской и Самарской губерний) или финнов-ингерманландцев. Встречается она и в Эстонии, где могла быть эстонским вариантом той же немецкой основы.

Если ваши предки носили фамилию Келле, то с высокой вероятностью они были либо ремесленниками-строителями, либо выходцами из прибалтийско-финской среды. Точнее можно сказать только после изучения семейных архивов и региональных переписей.