Фамилия Хлабынина — женская форма от Хлабынин, и её основа, скорее всего, связана с прозвищем, а не с чистым именем. В русских говорах слово «хлабыня» или «хлабынь» могло означать топкое место, болото, трясину. В словаре Владимира Даля «хлабыня» — это «глубокое место в реке, омут», а также «пропасть, бездна». Человек, получивший такое прозвище, мог жить у болота или омута, либо сам отличаться неустойчивым, «зыбким» характером — не случайно в языке есть глагол «хлабыстать» (болтать, качать). Суффикс -ин указывает на принадлежность: Хлабынин буквально «сын или потомок Хлабыни».

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным «хлаба» — бранным прозвищем для неряшливого или вялого человека. В таком случае прозвище Хлабыня могло закрепиться за медлительным или неопрятным крестьянином. Фамилия редкая, её географическое ядро, судя по открытым данным, тяготеет к северным и центральным областям России — Вологодской, Костромской, Ярославской. Там болотистая местность была обычной, и прозвища по ландшафту давали часто.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Хлабыстов, Хлабышев — показывает, что основа «хлаб-» была продуктивной в северных говорах, но в литературный язык не вошла. Это делает фамилию Хлабынина хорошим маркером локальной диалектной традиции: предки носителей были либо крестьянами, жившими у «хлабыни» (топи), либо людьми, за которыми закрепилась образная характеристика по поведению. Иных версий, например, от иноязычного корня, нет — слово явно славянское и звукоподражательное по происхождению.