Фамилия Хоботкова — это типичная русская фамилия, образованная от прозвища или нецерковного имени Хоботок. В её основе лежит слово «хобот», которое в древнерусском языке имело несколько значений. Прямое значение — нос, рыло животного, особенно слона, но в народной речи хоботком могли называть длинный нос человека, а также неповоротливого, неуклюжего или, наоборот, назойливого и приставучего человека. Суффикс -к- в основе (Хоботок) уменьшительно-ласкательный, поэтому прозвище могло относиться к человеку с небольшим, но заметным носом или к младшему в семье, кого так дразнили в шутку.

Фамилия образована по стандартной модели: к основе на -к- добавляется суффикс -ов-, указывающий на принадлежность («чей?» — Хоботков), а женская форма Хоботкова — это притяжательное прилагательное. Такие фамилии обычно закреплялись за потомками человека, которого в округе знали под этим прозвищем. В отличие от фамилий на -ин, которые образуются от основ на -а/-я, модель на -ов типична для прозвищ и мирских имён, оканчивающихся на согласный.

В исторических документах фамилия встречается редко, что говорит о её относительно позднем оформлении или локальном бытовании. Известно, что в XVI–XVII веках в русских землях фиксировались прозвища Хобот, Хоботок, а также фамилия Хоботов, особенно в новгородских и псковских землях. Хоботкова — более редкий вариант, возможно, возникший в центральных или южных регионах России, где уменьшительная форма была в ходу. Словарь русских фамилий Б. Унбегана относит подобные образования к группе фамилий от прозвищ, связанных с внешностью.

Однокоренные фамилии — Хоботов, Хоботнев, Хоботнин — различаются суффиксами, но восходят к тому же корню. Хоботкова выделяется именно уменьшительным оттенком: если Хоботов мог означать «сын того, кого звали Хобот», то Хоботков — скорее «сын Хоботка», то есть человека с более мягким или шутливым прозвищем. В сословном плане носители фамилии чаще всего были крестьянами или посадскими людьми, так как дворянские роды с такой фамилией не зафиксированы в родословных книгах.

Таким образом, фамилия Хоботкова — это прозвищное имя, закрепившееся за родом, где предок выделялся характерной внешностью (длинный или крупный нос) или поведением (назойливость, неуклюжесть). Сегодня она встречается нечасто, но сохраняет живой отпечаток народной наблюдательности, характерной для русской ономастики.