Основой фамилии Хоботникова послужило мирское имя Хоботник. Мирское имя Хоботник восходит к названию жука-долгоносика – хоботник. Давая младенцу такое имя, как Хоботник, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребенка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделено этот жук. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Хоботник, со временем получил фамилию Хоботникова.