Фамилия Хоботникова образована от мирского имени Хоботник. В древнерусской традиции мирские имена давали не при крещении, а в быту, и они часто восходили к названиям животных, птиц или насекомых. Хоботником на Руси называли жука-долгоносика — вредителя зерновых, которого отличает длинный вырост на голове, похожий на хоботок. Родители, нарекая ребенка Хоботником, следовали древнему обычаю: считалось, что если назвать дитя именем природного существа, то природа примет его за своего и наделит теми качествами, которыми обладает этот зверь или жук. В случае с долгоносиком это, скорее всего, живучесть и способность пробиваться сквозь трудности — вполне практичные пожелания для крестьянского ребенка.

Слово «хоботник» в русских говорах имело и другое значение. В некоторых регионарах так называли человека с большим носом или того, кто много и громко говорит, «работает хоботом», то есть ртом. Поэтому не исключено, что прозвище Хоботник мог получить и взрослый человек — за внешность или болтливость. Однако версия с жуком-долгоносиком выглядит убедительнее: она лучше вписывается в пласт древних мирских имен, которые давали детям по названиям насекомых (Жук, Комар, Муха, Паук и подобные).

Фамилия построена по стандартной для русских фамилий модели: к основе Хоботник прибавлен суффикс -ов, а затем окончание -а, указывающее на женский род. Первоначально Хоботников — это «сын Хоботника», а форма Хоботникова закрепилась за женой или дочерью Хоботникова. Такая модель образования фамилий — самая распространенная в России: по подсчетам лингвистов, около 60 процентов русских фамилий образовано именно так — от имен и прозвищ с помощью суффиксов принадлежности.

Встречается фамилия в основном в центральных регионах России, где земледелие было главным занятием населения, а значит, жук-долгоносик был хорошо знаком каждому крестьянину. В документах XVII–XVIII веков можно найти упоминания крестьян и посадских людей с прозвищем Хоботник, но точных сведений о знаменитых носителях фамилии в истории не сохранилось. Это не удивительно: фамилия редкая, и ее носители, судя по всему, принадлежали к крестьянскому или мещанскому сословию, редко попадавшему в летописи.

Интересно, что фамилия Хоботникова сохранила архаичное слово, которое сегодня почти вышло из употребления. Современный человек скорее вспомнит хобот слона, чем жука-долгоносика. А между тем в XIX веке слово «хоботник» фиксировали диалектные словари как общепонятное название насекомого. Так фамилия стала своеобразным памятником народной речи и народных верований.