Фамилия Хохлушин образована от личного именования Хохлуша, и в её основе лежит прозвище или мирское имя, связанное с внешностью или птицей. Разобраться, какая из версий ближе к истине, помогает сам корень слова.

Первая версия отсылает к миру природы. Имя Хохлуша этимологически связано со словом «хохлаточка» — так в народе называли хохлатую птицу, чаще всего курицу. Близко к нему и слово «хохлуха» — так в некоторых говорах именовали нырка, малую гагару или чубатку. В языческой традиции имя, данное по названию животного или птицы, должно было сделать ребёнка «своим» для природы: считалось, что так к нему перейдут полезные качества существа, давшего имя. Хохлуша в этом ряду — имя-оберег, каких было немало в старину.

Вторая версия более прозаична и касается человека. Прозвище Хохлуша могло возникнуть от слова «хохлища» — так в народе говорили о человеке с взлохмаченными, торчащими волосами. Не исключено, что именование указывало на густую шевелюру, кудри или привычку носить причёску с хохолком. Такое прозвище легко закреплялось за человеком и переходило к его детям.

Какая версия правдоподобнее? Обе имеют право на существование, но прозвищная кажется более естественной для бытового общения: называть соседа или родственника «Хохлушей» за характерную причёску проще, чем давать ребёнку птичье имя-оберег в эпоху, когда христианские имена уже вытеснили древние традиции. Однако полностью отбрасывать «птичью» версию не стоит — в северных говорах слова «хохлуша» и «хохлуха» действительно бытовали.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Хохлушин буквально значит «сын Хохлуши», «ребёнок Хохлуши». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Потомки человека по прозвищу Хохлуша со временем закрепили за собой фамилию Хохлушины.