Фамилия Хоронжий — редкий случай, когда исходное слово почти не изменилось за столетия. В её основе лежит польское `chorąży` — «хорунжий», то есть знаменосец. В Речи Посполитой и в Малороссии хорунжим называли урядника, который нёс полковое знамя. В гетманской Украине эта должность была выборной и почётной: полковой хорунжий входил в старшину, а генеральный хорунжий — в ближний круг гетмана. Так что предок носителя этой фамилии, скорее всего, был не рядовым казаком, а человеком при должности, с правом голоса на раде.

Обратите внимание на суффикс. Фамилия заканчивается на `-ий`, а не на `-ов` или `-ин`. Это типичная модель для украинских и польских фамилий, образованных от названий чинов и званий: Писарчук, Сотник, Атаманчук — и Хоронжий. В русскую традицию такие фамилии переходили почти без изменений, без добавления типичных русских суффиксов принадлежности. Если бы фамилия была великорусской, она звучала бы как Хорунжев или Хорунжин.

Есть и вторая, менее распространённая версия. В некоторых говорах «хорунжий» или «хоронжий» могло быть прозвищем — не по должности, а по характеру или внешности. Например, так могли назвать человека, который ходил важно, «как хорунжий», или того, кто любил носить что-то яркое, заметное, как знамя. Однако эта версия слабее: фамилия слишком точно повторяет форму воинского звания, чтобы быть случайным прозвищем.

Фамилия почти не встречается за пределами Украины и юга России. В центральных и северных областях России её носители — это, как правило, потомки переселенцев с Украины или казаков. Встречаются варианты написания: Хорунжий, Хоронжей, но Хоронжий — один из самых старых, с устоявшейся украинской огласовкой.