Фамилия Хованскова чаще всего связана с местом, а не с личным прозвищем. В её основе лежит гидроним — название реки Ховань (или Хованка), которая протекает в глухой, лесистой местности Шаховского района Московской области. Название реки образовано от глагола «ховаться», то есть «прятаться, скрываться». Речка словно прячется среди лесов, полностью оправдывая своё имя. Вероятно, родоначальник Ховансковых родился или долго жил на берегу этой реки, а его потомки закрепили за собой обозначение «с Ховани» — Хованские, а затем и Ховансковы.

Впрочем, есть и другая версия, которая уводит нас от географии в сторону личного прозвища. Украинский глагол «ховати» означает «хранить, беречь», «таить, укрывать», а также «воспитывать». Отсюда — прозвище Хован. Так могли назвать любимого и оберегаемого ребенка, которого баловали и лелеяли, либо, наоборот, скрытного и замкнутого человека, который многое таит в себе.

Существует и третья, более неожиданная трактовка. Украинское слово «хованець» означает «черт, домовой». Славяне нередко давали детям имена злых духов в надежде, что те не тронут ребенка, носящего с ними одно имя. Считалось, что такая «охранительная» кличка работает как оберег: нечистая сила примет своего и не станет вредить. Если прозвище Хован возникло именно так, то оно несло в себе защитную функцию, а фамилия Хованскова сохранила память об этом древнем суеверии.

Из всех версий наиболее правдоподобной выглядит первая, географическая. Суффикс -ск- в фамилии — типичный признак «географических» фамилий, которые образовывались от названий местностей, рек и сел (сравните: Озерский, Полянский). Прозвищные фамилии с этим суффиксом встречаются реже. К тому же сама форма Хованскова, а не Хованская, говорит о более позднем оформлении фамилии, когда к основе добавили еще и патронимический суффикс -ов. Это распространенная модель: сначала человек звался Хованский, а его потомки, отвечая на вопрос «чей вы?», становились Ховансковыми. Так что, скорее всего, предки носителей этой фамилии действительно жили у реки Ховань и носили имя, данное им по месту жительства.