Фамилия Хубуева — яркий пример того, как географическая привязка и этническая принадлежность могут стать основой для родового имени. В её основе лежит осетинское слово «хубур» или «хъубур», что переводится как «бедный», «несчастный», «сирота». Прозвище Хубу, от которого образована фамилия, могли дать человеку, оставшемуся без родителей, или тому, кто жил в нужде. Однако не стоит думать, что это указывает на унизительное положение предка — в традиционных обществах такие имена часто давали как оберег, чтобы отвести от ребёнка настоящие беды.

Суффикс -ев указывает на русскую модель оформления фамилий, которая закрепилась за многими кавказскими и тюркскими фамилиями после вхождения регионов в состав Российской империи. В самой Осетии фамилия могла звучать как Хубуата или Хубуты, а на письме фиксироваться по-разному. Характерно, что фамилия Хубуева распространена в основном среди осетин, особенно в Дигорском ущелье, где диалектные особенности языка сохраняют древние формы слов.

Встречается и альтернативная версия, связывающая фамилию с тюркским корнем «хубу» — «сосуд», «кувшин». Согласно этой гипотезе, предок мог заниматься гончарным делом. Но эта версия менее убедительна, так как не находит массового подтверждения в осетинской антропонимике, где фамилии от названий профессий обычно образуются иначе (например, через суффикс -он).

Таким образом, носитель фамилии Хубуева, скорее всего, происходит из осетинской семьи, где предок носил охранительное или описательное прозвище, связанное с бедностью или сиротством. Фамилия недвусмысленно указывает на осетинские корни и, вероятнее всего, на происхождение из Дигорского ущелья.