Фамилия Хурдаков — редкий случай, когда основа очевидна, а вот её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров) или названий профессий (Кузнецов, Мельников), эта фамилия явно прозвищная. В её основе лежит слово «хурда» или «хурды», которое в русских говорах имело несколько значений.

Самое распространённое значение — мелкий сор, хлам, остатки, всякая мелочь. В переносном смысле так могли назвать придирчивого, дотошного человека, который обращает внимание на каждую мелочь, или, наоборот, человека несерьёзного, «мелкого» по характеру. Вторая версия, более редкая, связывает слово «хурда» с диалектным глаголом «хурдыбачить» — делать что-то быстро, небрежно, на скорую руку. В этом случае прозвище Хурдак мог получить торопыга или неаккуратный работник.

Суффикс -ов указывает на стандартную модель образования русских фамилий в XIX веке: Хурдак (прозвище) + ов = сын Хурдака, потомок Хурдака. Географически фамилия тяготеет к южнорусским и среднерусским областям, где диалектное слово «хурда» было в ходу. Встречается она нечасто, что делает её ценной для генеалогии: носители фамилии, скорее всего, происходят из одного или нескольких компактных родов.

Сравнение с однокоренными фамилиями, такими как Хурдин или Хурдов, показывает, что корень «хурд-» был продуктивным в прозвищной среде. Версия о тюркском происхождении (например, от слова «хурд» — «маленький» в персидском, заимствованном тюркскими языками) менее правдоподобна для фамилии с русским суффиксом -ов, но полностью исключать её нельзя — в зонах смешанного населения такое влияние возможно. Однако для рядового носителя фамилии Хурдаков наиболее вероятным предком остаётся человек, которого в деревне прозвали за его придирчивость или суетливость — Хурдаком.