Основой фамилии Киндеева послужило церковное имя Киндей. Фамилия Киндеева восходит к мужскому крестильному имени Киндей или к форме имени Акиндин. Киндей в переводе с греческого означает «опасный», а Акиндин - «безопасный». Согласно другой, менее правдоподобной, версии, фамилия Киндеева образована от прозвища Киндей. Вероятно, оно происходит от марийского слова «кинде» - «хлеб». Поэтому можно предположить, что основатель рода Киндеевых был пекарем. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Киндей, со временем получил фамилию Киндеева.