Фамилия Киндирбаев на первый взгляд кажется очевидной по составу, но при ближайшем рассмотрении ставит перед исследователем несколько вопросов. Её основа — Киндирбай — представляет собой сложное имя, типичное для тюркской антропонимической традиции. Вторая часть, «бай», в переводе с тюркских языков означает «господин», «хозяин», «богатый человек» и была чрезвычайно популярна в составных именах у казахов, башкир, татар и других народов. Первая же часть, «киндир», вызывает больше споров.

Самая вероятная версия связывает «киндир» с казахским или башкирским словом «кендір» (конопля). В таком случае имя Киндирбай могло означать «богатый коноплей» или «владелец конопли» — в переносном смысле, как человек, имеющий отношение к выращиванию или торговле этим растением, которое широко использовалось в хозяйстве для изготовления веревок, канатов и грубой ткани. Менее распространённая, но возможная трактовка отсылает к глагольной основе «кендіру» — «расширять», «распространять». Тогда имя можно интерпретировать как «расширяющий богатство» или «приумножающий», что тоже логично для пожелательного имени.

Формант -ев (а не тюркский -улы/-кызы) указывает на то, что фамилия прошла русификацию, характерную для народов Российской империи в XIX–XX веках. Скорее всего, Киндирбаевы — это потомки человека по имени Киндирбай, жившего в среде казахских или башкирских родов. Географически фамилия наиболее плотно представлена в Казахстане, особенно в западных и южных областях, а также среди башкирского населения Челябинской и Оренбургской областей России. Сословно предки, скорее всего, относились к скотоводам или земледельцам, но сам факт составного имени с «баем» говорит о том, что в роду ценили достаток и хозяйскую хватку. Встречаются и варианты написания — Киндирбаев, Кендирбаев — что отражает разницу в диалектном произношении.