Фамилия Киндий восходит к мужскому крестильному имени Киндей или к форме имени Акиндин. Киндей в переводе с греческого означает «опасный», а Акиндин - «безопасный». Согласно другой, менее правдоподобной, версии, фамилия Киндий образована от аналогичного прозвища. Вероятно, оно происходит от марийского слова «кинде» - «хлеб». Поэтому можно предположить, что основатель рода Киндий был пекарем.