Фамилия Киприкова — женская форма, а её мужской вариант — Киприков. В основе этой фамилии лежит редкое для русских земель крестильное имя Киприк, которое является народной формой церковного имени Киприан (в современном звучании — Киприан или Куприян). Имя это восходит к латинскому Cyprianus — «кипрский, уроженец Кипра». В православных святцах известно несколько святых с этим именем, самый почитаемый — священномученик Киприан, епископ Антиохийский.

Словообразовательная модель здесь проста и типична для русских фамилий: к основе имени Киприк добавляется патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Киприка). Фамилия Киприков, таким образом, означает «потомок Киприка». Интересно, что имя Киприк в народной среде могло звучать и как Куприк, откуда пошли фамилии Куприков и Куприянов — однокоренные, но с разными суффиксами. Суффикс -ов в фамилии Киприков указывает на то, что она образовалась в среде, где преобладала великорусская модель именования, скорее всего, в центральных или южных губерниях.

Географически фамилия Киприкова не является массовой. Её следы чаще встречаются в документах по Курской, Воронежской и Орловской губерниям — регионам, где имя Киприан в форме Киприк было особенно употребительно среди крестьян и мещан. В некоторых говорах имя могли произносить с ударением на первый слог — Ки́прик, что давало ту же фамилию. Встречается она и у казачества, например, в станицах Дона.

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — происхождение от прозвища Киприк, которое могло быть связано с диалектным словом «киприть» (капризничать, дурить) или с названием птицы киприк (так в некоторых областях называли чибиса). Однако связь с каноническим именем выглядит гораздо убедительнее: церковные имена в народной переработке давали огромное количество фамилий, и Киприков — один из таких примеров, сохранивший редкую форму исходного имени.