Фамилия Киприянов образована от крестильного имени Киприян, которое имеет латинские корни и переводится как «житель Кипра». Это имя вошло в православный календарь благодаря святому Киприану, епископу Карфагенскому, жившему в III веке. На Руси имя Киприян (в просторечии — Куприян) было распространено среди разных сословий, но чаще встречалось в среде духовенства и крестьянства. Отсюда и фамилия Киприянов — типичная русская фамилия с патронимическим суффиксом -ов, который указывает на принадлежность потомку человека по имени Киприян.

Словообразовательная модель проста: к основе Киприян- добавили суффикс -ов, означающий «чей?» — то есть сын или потомок Киприяна. На письме фамилия нередко встречалась в варианте Куприянов, что отражает народное произношение имени (аканье и замена «и» на «у»). В документах XVII–XVIII веков обе формы фиксируются параллельно, и это не ошибка, а живое языковое явление.

Географически фамилия Киприянов чаще всего встречается в центральных и северных регионах России — в Вологодской, Архангельской, Костромской областях. Там имя Киприян было особенно популярно среди старообрядцев, которые нередко давали детям редкие или архаичные имена в противовес официальной церкви. Поэтому среди носителей фамилии Киприянов можно встретить потомков староверов, хотя основная масса — это обычные крестьяне и мещане, получившие фамилию по отцу.

В ономастических справочниках фамилия Киприянов обычно не вызывает споров: её происхождение прозрачно. Редкие альтернативные версии — например, от прозвища Киприян, данного человеку, торговавшему кипрскими товарами, — маловероятны, так как торговые связи с Кипром в средневековой Руси были минимальны. Правдоподобнее всего именно каноническое объяснение: имя → отчество → фамилия.