Основой фамилии Кирдякин послужило мирское имя Кирдяка. Имя Кирдяка представляет собой уменьшительную форму мордовского мужского имени Кирда, которое образовано от глагола «кирдемс» - «терпеть», «держать». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Кирдяка, со временем получил фамилию Кирдякин.