Фамилия Киргинцев — одна из тех, что прямо указывают на место, откуда человек родом. В её основе лежит не имя и не профессия, а прозвище Киргинец, которое давали выходцу из села Киргинцево. Это село существует и сегодня — оно находится в Купинском районе Новосибирской области. Такая модель образования фамилий (название села → прозвище жителя → фамилия на -ев/-ов) очень характерна для русских фамилий, особенно среди крестьянства, которое массово получало фамилии по месту жительства в XIX веке.

Сам топоним Киргинцево, скорее всего, имеет не тюркское этническое происхождение (не от слова «киргиз»), а восходит к местному географическому термину. По одной из версий, в основе лежит киргизское слово «киргин» — половодье, разлив реки. Если это так, то село получило название по своему расположению у водоёма, который часто разливался, или у реки с таким именем. Версия выглядит правдоподобной: в Сибири немало топонимов, образованных от местных гидрографических терминов.

Суффикс -ев в фамилии Киргинцев — стандартный патронимический (или, точнее, «ойконимический») формант, означающий «сын Киргинца» или «принадлежащий Киргинцу». Фамилия закрепилась в форме притяжательного прилагательного, что типично для русской ономастики. Интересно, что в современных документах встречаются варианты написания с одной «н» (Киргинцов) или через «а» (Кирганцев), но основной вариант — Киргинцев — зафиксирован в официальных справочниках.

С географией бытования фамилии всё логично: основные очаги — Новосибирская область и соседние регионы Сибири. Встречается она и на Урале, и в центральной России, но значительно реже. Это фамилия, которая не получила широкого распространения за пределами исходного ареала, что делает её хорошим маркером сибирских корней рода.