Фамилия Киргинцева образована от прозвища Киргинец, которое восходит к топониму Киргинцево. Киргинцево — это название села, расположенного в Купинском районе Новосибирской области. Вероятно, предок Киргинцевых был выходцем из этого населенного пункта. Сам топоним, вероятно, восходит к киргизскому нарицательному «киргин», которое в на русский язык переводится как «половодье». Не исключено, что село располагается недалеко от водоема, реки. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Киргинец, со временем получил фамилию Киргинцева.