Фамилия Кирьякин образована от имени Кирьяк, которое в свою очередь является народной формой крестильного имени Кириак (в переводе с греческого — «господень», «принадлежащий Господу»). Имя Кириак давали в честь нескольких раннехристианских святых, в том числе святого Кириака Отшельника и священномученика Кириака Иерусалимского. В русском быту имя быстро обросло уменьшительными вариантами: Кирьяк, Кирьян, Киря — отсюда и пошли фамилии Кирьяков, Кирьянов, Кирьякин.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Кирьякин буквально значит «сын Кирьяка». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а, -я. В данном случае основа Кирьяк- дала притяжательную форму Кирьякин, так же как Иванов — от Иван, а Ильин — от Илья.

Интересно, что фамилия Кирьякин встречается реже, чем Кирьяков или Кирьянов. Это связано с тем, что форма Кирьяк считалась более просторечной и чаще бытовала в северных и центральных губерниях России, где окончание -ин было распространённее, чем -ов. В южных и западных регионах предпочитали вариант Кирьяков.

Носители фамилии Кирьякин в основном происходят из крестьянской и мещанской среды. В документах XVIII–XIX веков Кирьякины чаще всего фиксировались в Вологодской, Костромской и Вятской губерниях — областях, где имя Кирьяк было особенно популярно. Среди известных людей с этой фамилией нет громких исторических фигур, что как раз характерно для фамилий, возникших в низших сословиях и не попавших в дворянские родословные книги.

Встречаются и редкие варианты написания — Кирьякин с двойным «к» (Кирьяккин) или с буквой «и» вместо «ы» (Кириакин), но они могут быть следствием ошибок при переписи или местного произношения. Основная форма фамилии — Кирьякин — устойчиво сохраняет корень и суффикс, не меняясь уже три столетия.